根據(jù)2008年中國科學院黨組（擴大）會議和中國科學院—上海市政府院市合作協(xié)議精神，中國科學院與上海市政府共同建設上海高研院。經(jīng)過3年籌建，上海高研院15萬平方米科研用房建成并投入使用，近1.5億元的科研裝備到位并運行，建成交叉前沿與先進材料、信息科學與技術(shù)、空間科技、能源與環(huán)境、生命科學與技術(shù)5個研究部，集聚形成了一支近800人的海內(nèi)外高層次人才隊伍。研發(fā)團隊中全職博士海內(nèi)外比例保持在1：1，榮獲上海市首批“海外高層次人才創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)基地”。
上海高研院承擔了國家重大科技專項、科技部“863”、“973”、科技支撐計劃、中科院戰(zhàn)略性先導專項、知識創(chuàng)新工程重大項目、上海市重大科技項目等各類科技創(chuàng)新項目195項，打造了包括宏觀量子現(xiàn)象研究平臺、城市公共安全平臺、農(nóng)產(chǎn)品生命周期信息管理平臺、儲能技術(shù)研發(fā)平臺、干細胞與再生醫(yī)學研究平臺等16個優(yōu)勢研發(fā)平臺。同時，將立足長三角地區(qū)經(jīng)濟社會發(fā)展資源優(yōu)勢，為戰(zhàn)略新興產(chǎn)業(yè)提供集成技術(shù)解決方案，探索科技與經(jīng)濟、教育、金融、文化結(jié)合的發(fā)展模式，成為具有國際競爭力的集研、產(chǎn)、學、用為一體的多學科交叉綜合性科教機構(gòu)。
